Me pasé de los 90 días permitidos en Portugal. Soy mexicana

Hola me casé con un portugués y nos fuimos a vivir a Portugal, saqué cita en el SEF pero me la dieron hasta marzo, ya no pensaba salir del país hasta que me dieran mi cartao de residente pero por problemas familiares tuve que regresar a Mexico.
Tengo dos problemas :
Cuando salí de migración en Madrid me dijeron que iba a ser muy difícil regresar porque me pase de los 90 días.
Estoy embarazada y queremos que mi hijo nazca en Portugal pero ahora cómo regreso, ayuda