Amparo por matrimonio en Ecuador

Hola. mi pareja y yo nos queremos casar: en su momento se solicitó un amparo para que le den su residencia debido a que tenemos una unión de hecho. Sin embargo, para casarnos el registro civil solicita que anulemos la unión de hecho, la regularicemos en el dpto. legal y con esetado civil solteros nuevamente nos presentemos a la entrevista del matrimonio. Sin embargo, nos preocupa que al anular y notarizar el fin de unión de hecho su visa de residente se termine. Cómo hacemos para casarnos?