Lavorare a Basilea....ma vivere dove ?

Salve a tutti, sono nuovo in questo forum e avrei bisogno di qualche consiglio, mi scuso se magari un po ingenuo.
Sono un italiano che vive a Ginevra da 4 anni e adesso devo trasferirmi a Basilea. Ho ancora il permesso B, penso per tutto il 2016, perche' a partire dal 2017 faro' la richiesta del C.

Il mio dubbio e' il seguente: se saro' costretto a prendere un appartamento in Francia o in Germania e fare il pendolare per andare al lavoro cosa cambia dal punto di vista delle tasse e del mio permesso B ?
Che consiglio potete darmi dal punto di vista della convenienza ?

Grazie e saluti a tutti,
Mario